Dibangun di kawasan seluas lebih dari 80 Ha di Surabaya Barat, Graha Natura menggandeng sejumlah lembaga ilmiah, yaitu pihak pengelola Kebun Raya Purwodadi dan Seameo Biotrop (South East Asia Regional Centre for Biological Tropical) untuk program konservasi lingkungan yang menempati hampir separuh dari ruang terbuka hijau di seluruh area kawasan perumahan.

Melalui kerjasama ini Graha Natura menanam sebanyak 10.000 pohon dari 1.000 atau 25% jenis pohon yang ada di Indonesia.
Salah satu program yang dijalankan adalah pengadaan area pembibitan varietas mangga di lahan melalui program “Kebun Mangga Persahabatan”, dimana program ini merupakan salah satu bentuk konservasi lingkungan dan edukasi yang ditawarkan oleh Graha Natura.Desain lingkungan dan landscape Graha Natura dipercayakan kepada seorang desainer internasional, Karl Princic, untuk menciptakan kawasan yang tertata asri dan teduh dengan banyak ruang terbuka hijau dan pepohonan besar, memberikan banyak pasokan oksigen (O2) yang akan mengoptimalkan kualitas gaya hidup sehat penghuninya.

Graha Natura juga berkomitmen untuk mewujudkan kawasan perumahan lebih sehat yang bebas limbah rumah tangga dengan membangun sistem pusat pengolahan limbah terpadu atau Integrated Sewage Treatment Plant (ISTP) yang mampu mengolah seluruh limbah cair dan padat dari rumah tangga secara terpusat. Melalui penerapan teknologi ini maka setiap rumah di Graha Natura bebas dari septic tank.